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Illumina测序总结

已有 4770 次阅读 2017-6-10 17:12 |系统分类:科研笔记| Sequencing, RNA测序, 链特异性, DNA直接测序

   关于Illuminate测序过程一直不明白,这是自己总结的关于Illumina测序的知识,花了好几天的时间,总算理清了。我觉得应该不存在问题。网上搜集的资料鲜有对Illuminate测序过程讲解较清楚的文档,本着知识共享的理念,这里分享自己整理的文档(见附件),希望起到抛砖引玉的作用。我整理的文档比较容易懂,但是测序过程各种各样的引物,而且每个引物的叫法没有统一标准,容易混乱,要真想弄清楚,还是要花些时间(我的文档有些引物的名字是按照我的理解命名的,确保文档从前到后理解方便,只有知道测序原理,才能知道引物来干什么)。


   该文档着重讲解  RNA测序  DNA直接测序  区分链(链特异性 strand specific)测序     不区分链(非链特异性 nonstrand specific)测序   单端测序(single end sequencing,SE sequencing) 双端测序(pair end sequencing, PE sequencing) Index等内容,并给出了一套测序的引物。不同测序过程不同,引物碱基组成不一样,但是模式一样。搞懂引物做什么和引物的碱基组成对明白测序过程很重要(这里面涉及很多关于序列的知识  反向   互补   反向互补等)。


这些引物包括如下


TruSeq Universal Adapter

TruSeq Indexed Adapter


PCR Primer 1.0

PCR Primer 2.0


flow cell 锚定 TruSeq Universal Adapter

flow cell 锚定 TruSeq Indexed Adapter


Read 2 Sequencing Primer

Multiplexing Index Read Sequencing Primer

Read 1 Sequencing Primer


Illumina测序.rar







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